刘仁根同志自1975年底参加工作以来，先后在国家建设委员会城市建设局、国家城市建设总局、城乡建设环境保护部和中国城市规划设计研究院工作。1987年8月，任城市规划师；1992年9月，任高级城市规划师；1999年12月，任教授级城市规划师；2000年10月，获国家注册城市规划师执业资格。
1983年3月以前，刘仁根同志主要从事城市规划管理工作。1976、1978年，两次参加了河北省唐山市震后重建规划工作，具体负责了丰润新区的规划总体布局和工业调整与选址，该规划已经党中央、国务院批准实施；1976年，参加了“文革”后的首次城市总体规划评审会（沈阳），参与起草了国家建委城建局负责人的讲话稿；1977年，为召开全国城市规划工作会议，多次参加了四川、南京有关省市城市规划和城市建设的调研工作；1978年，参与组织了全国南方省市旅游规划工作座谈会，参与了中国城市规划学会的成立工作；1977至1979年间，《城市规划》杂志创刊后，协助做了大量的的编辑、编务工作；1980年初，参与了对深圳特区的规划调研工作；1981年，参加了国家建委、城建总局组织的小城镇规划建设调研工作；1982年，参与组织了南方县域规划工作座谈会。
1983年初至1988年底，在中国城市规划设计研究院历史理论研究所工作期间（1985年初任副所长），主持完成了贵州省兴义市中心区城市总体规划编制工作，该规划成果于1989年6月27日得到省人民政府的批准。在该所工作期间，完成了《当代中国》丛书《当代中国的城市建设》卷一书的组织、撰稿和编辑工作。这套丛书是经中央书记处1982年11月讨论通过、由中央宣传部负责、列入国家“七.五”计划研究工作的重点项目。刘仁根同志是《当代中国的城市建设》一书的主要撰稿人和主要编辑之一。该书已于1990年由中国社会科学出版社出版发行。
1988年底，刘仁根同志调任我院城市规划经济研究所所长，在他的组织和主持下，完成了国家土地局《2000年全国村镇用地预测》（全国土地利用总体规划研究子题）、《河北省遵化县县域规划》、《河北省迁安县县域规划》、建设部“七.五”重点科研项目《市域规划编制方法与理论研究》、建设部下达的《市政公用事业“八.五”及十年规划预测》、承担了《中国土木建筑百科辞典》有关城市人口部分条目的撰写以及国家计委、国家建委项目《陇海兰新地带发展与布局规划》等一批有重大影响的部级科研规划项目。在《2000年全国村镇用地预测》项目中，他独自完成了对河北省廊坊试点地区和霸县试点县以及西北省市区的调研工作，起草了专题研究报告。1996年，《全国土地利用总体规划研究 我院子课题：2000年村镇用地预测》获国家科技进步三等奖。1995年，《陇海兰新地带城镇发展研究》获建设部科技进步三等奖。在国家计委、国家建委《陇海兰新地带发展与布局规划》项目中，他担任规划综合组副组长（国家计委、国家建委和中规院各一名）兼任规划综合组办公室主任，工作涉及两个部委，10个省、市、自治区和若干大专院校、科研部门，规划要点已经国务院办公厅同意，印发18个省、市、自治区和部委，供制定计划时参考。1990年11月，参与组织了全国新兴城市发展战略研讨会，全国20多位中小城市的市长参加了研讨，取得了很好的效果。
1992年初以后，刘仁根同志虽然担任院的领导职务，承担了大量行政管理工作，但是始终没有离开过城市规划科研与设计实践。1994年3月至1995年3月期间，他兼任我院深圳分院院长，组织完成了40多项规划设计任务，为珠三角地区的城市规划与建设，为院的发展做出了重要贡献。1998年，他主持完成了建设部下达的《小城镇建设技术政策研究》项目。1999年9月至2001年6月，他作为第一负责人，组织我院和中国建筑设计研究院、沈阳建筑工程学院的专家，完成了国家科技部下达的《小城镇规划标准研究》课题,并获建设部。
1993年以来，刘仁根同志还长期担任中国城市规划学会区域规划与城市经济学术委员会的秘书长和常务副主任工作，对该专业学术组织的成立、换届、年会与学术发展，做了大量富有成效的工作。
刘仁根同志还在国内外的学术刊物上发表了数篇论文，在韩国和台湾的学术会议上、在中日科技经济交流研讨会上进行过论文交流。